Viroses respiratoires des volailles : apport des nouveaux outils diagnostiques pour caracteriser les virus et les coïnfections

Les syndromes respiratoires sont parmi les plus fréquemment rencontrés en élevage de volailles de chair. Ils n’impactent pas seulement la croissance et la viabilité des animaux, mais mènent également à des arthrites bactériennes secondaires et des retraits à l’abattoir. Les principaux virus aviaires à tropisme respiratoires sont les paramyxovirus aviaires de type 1 (PMV-1), les virus influenza A (VIA), le coronavirus de la bronchite infectieuse (VBI), le métapneumovirus (aMPV), et le virus de la laryngotrachéite infectieuse (LTI). Les lésions primaires dues à un ou plusieurs virus sont le plus souvent aggravées par la surinfection par une ou plusieurs bactéries. Le laboratoire d’analyses vétérinaires sera très utile pour déterminer le ou les agents primaires et les agents de surinfection. L’usage des outils de biologie moléculaire et en particulier des tests PCR s’est démocratisé et a largement contribué à une meilleure connaissance des infections respiratoires. Les perspectives d’apport des outils de la génomique concernent essentiellement une meilleure connaissance des coïnfections au niveau de l’appareil respiratoire. Les perspectives sont extrêmement prometteuses et permettront dans quelques années aux vétérinaires et aux organisations de production de disposer de données toujours plus précises et rapides pour éclairer la décision dans la prise en charge d’un lot de volailles ou la définition d’un plan de prophylaxie.