Une nouvelle facette du génome de poule : les gènes 'longs non codant'

De récents travaux effectués chez l’homme et des organismes modèles ont montré l’existence massive d’un nouveau type de gènes : des gènes transcrits en longs ARN (≥ 200 nt) mais ne codant pas de protéine – ces gènes sont appelés gènes à ARN longs non-codants (ARNlnc). Ces ARNlnc sont une composante majeure du transcriptome et seule une petite fraction de ces ARNlnc est décrite aujourd’hui dans les bases de données publiques. Nos travaux sur les ARNlnc de poule ont permis de montrer que le séquençage de transcrits (RNA-Seq) sur plusieurs réplicats biologiques de deux tissus (foie et tissu adipeux) permet de prédire un catalogue d’ARNlnc plus exhaustif pour les tissus considérés que ce qui est proposé dans les bases de données. Nous avons pu confirmer également que les caractéristiques des ARNlnc de poule sont similaires à celles décrites chez la souris ou chez l’Homme (transcrits plus courts, moins d’exons, séquences moins conservées entre les espèces, expression plus tissu spécifique et moins importante que les ARN  codant pour des protéines  (ARNm)). Nous mettons également en lumière un couple d’ARNlnc et ARNm (DHCR24) adjacent sur le génome et en position divergente dont l’expression est fortement corrélée et dont la position est conservée chez l’Homme suggérant un mécanisme de régulation commun via un promoteur dit « bi-directionnel » qui serait impliqué dans la synthèse du cholestérol.