LDgenX : Analyse et expertise génomique pour la conservation et la biodiversité

La prise de conscience sociétale de l’importance de la biodiversité pour le fonctionnement des écosystèmes et la pérennité des espèces n’est apparue qu’à la fin du vingtième siècle. Ainsi est née la biologie et la génétique de la conservation comme discipline scientifique étudiant la biodiversité de l’échelle moléculaire à l’échelle écosystémique. Différentes pressions anthropiques, telles que la destruction des milieux naturels et la surexploitation des ressources, ont entrainé un déclin drastique de la biodiversité à toutes les échelles impactant ainsi le potentiel évolutif des espèces. Il devient indispensable d'intégrer la génétique dans les programmes de conservation afin d'appréhender les réponses des espèces face aux changements environnementaux. Objectif Protéger les écosystèmes et les espèces qui les peuplent sans intégrer la dynamique évolutive sous-jacente n'est plus suffisant pour protéger la biodiversité. En effet, certaines mesures aux effets directement positifs sur la démographie (repeuplement, translocation) peuvent en contrepartie avoir des conséquences négatives sur l’évolution des populations en entrainant des pertes de diversité génétique et/ou d’adaptations locales. C’est pourquoi aujourd’hui nous mettons en lumière l’utilisation de marques génétiques pour un meilleur suivi des populations et des écosystèmes. Méthodologie Pour répondre à ces problématiques de conservation et de biodiversité, nous mettons en place plusieurs approches (i) de génétique des populations via du séquençage haut-débit et une analyse approfondie des marqueurs identifiés ; (ii) de sélection de caractères d’intérêts et d’étude de plan de croisement pour améliorer les populations d’aquaculture ; et (iii) d’ADN environnemental pour une meilleure identification de nouveaux pathogènes dans les milieux et également une meilleure analyse de la biodiversité, via du séquençage de longs fragments ADN. Conclusion Les avancées récentes en recherche dans le domaine de l'analyse génomique offrent des outils puissants pour une prise de décisions précises, de gestion des populations efficaces, identifier les populations en danger et concevoir des stratégies de conservation pertinentes. En combinant des données génomiques avec des données phénotypiques, les gestionnaires de la conservation peuvent prendre des décisions plus éclairées et élaborer des stratégies de gestion plus efficaces pour protéger les espèces menacées et maintenir la diversité biologique. Ainsi, l'expertise génomique promet de jouer un rôle de plus en plus important dans les efforts de gestion des populations et des écosystèmes.