La nouvelle interface web du rnoea (reseau national d’observations epidemiologiques en aviculture)

Depuis sa création en 1988, le RNOEA (Réseau National d’Observations Epidémiologiques en Aviculture) créé et géré par l’Anses Ploufragan, permet de surveiller l’évolution épidémiologique des maladies aviaires en France et de détecter les émergences. La participation au RNOEA est basée sur le volontariat de plus de 50 correspondants adhérents (vétérinaires praticiens et laboratoires d’analyses vétérinaires) qui transmettent les données des maladies aviaires observées au cours de leur activité. Depuis 2017, une Interface Web a été développée afin d’optimiser le fonctionnement du RNOEA. La transmission des données par les adhérents se fait via l’interface Web du RNOEA : ils y saisissent leurs signalements ou déposent leurs fichiers de données laboratoires, extraits à partir de leur base de données interne. Trois types de données sont ainsi collectés: les résultats d’analyses des laboratoires, les signalements des préoccupations sanitaires et les incidences mensuelles des maladies observées par les vétérinaires praticiens. Un programme développé sous R permet de coder les signalements transmis par fichier et d’harmoniser les données avant leur importation dans la base de données du RNOEA. En retour les adhérents ont accès à une application Shiny sous R, dans laquelle des recherches spatio-temporelles interactives peuvent être réalisées sur l’historique des données depuis 1989. Cette consultation propose notamment des graphiques d’évolution temporelle du nombre de signalements et de la fréquence relative d’une maladie (% de la maladie par rapport à l’ensemble des signalements dans une production donnée) et des cartes de répartition des signalements des maladies au niveau départemental ou régional. Les sorties graphiques dépendent de la sélection selon les filtres: maladies, pathogènes, espèces, étages de production et période. L’accès à l’interface Web est sécurisé, réservé uniquement aux adhérents du RNOEA, signataires de la charte, qui garantit notamment l’anonymat et la confidentialité des données. La nouvelle interface Web du RNOEA est un outil interactif, réactif et évolutif permettant d’optimiser le fonctionnement du RNOEA pour une meilleure surveillance des maladies aviaires en France grâce à une participation active et volontaire des adhérents.