Publié le 1 mars 2015
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Le programme ANR UtOpIGe vise à évaluer l’intérêt de la sélection génomique dans des filières pyramidales, où la sélection est menée sur un noyau de taille restreinte, avant une large diffusion du progrès génétique via les étages successifs de multiplication et production. Nous présentons ici les résultats préliminaires dans un schéma de sélection de poules pondeuses, où nous analysons également d’éventuelles interactions Génotype x Environnement (GxE), au travers de deux régimes alimentaires différenciés sur le niveau d’énergie apporté (régime Basse Energie, BE, à 2455 kcal vs. régime Haute Energie, HE, à 2881 kcal). La population de référence est constituée par 453 coqs d’une lignée pure commerciale, génotypés avec une puce haute densité (la puce Affymetrix® Axiom® HD 600k SNP). Les phénotypes associés sont ceux de 31381 filles de ces coqs, obtenues par croisement avec une autre lignée, élevées en cages multiples et soumises pour moitié à l’un ou l’autre des deux régimes alimentaires. La validation consiste à évaluer puis sélectionner parmi 551 coqs candidats, fils des précédents. Les coqs candidats sont simplement génotypés au moment du choix et les performances de leurs sœurs ne sont pas encore disponibles. Un index génomique est estimé, selon la procédure « Single Step ». La présente analyse porte sur le poids des œufs à 65 semaines. Alors que les paramètres génétiques obtenus avec l’information des marqueurs sont assez semblables à ceux obtenus en lignée pure avec l’évaluation classique, les indices génomiques calculés sont nettement plus précis que des indices sur ascendance, avec un CD deux fois plus élevé pour les candidats connus uniquement sur génotype. Par ailleurs, pour le poids d’œuf on ne constate pas d’interaction GxE notable (corrélation génétique estimée >0.90) entre les régimes. Ces résultats encourageants plaident en faveur de la mise en place d’une sélection génomique de routine chez la poule pondeuse.