Etude épidémiologique de la maladie du sommeil de la carpe en France

La maladie du sommeil de la carpe koï (KSD), causée par le Carp Edema Virus (CEV), est associée à de fortes mortalités de carpes communes et koï en France depuis les années 2010. Cependant, le virus n’étant pas réglementé et la maladie étant souvent ignorée ou confondue à tort avec d’autres maladies virales, les foyers de KSD ne sont pas toujours signalés. La maladie est donc probablement sous-diagnostiquée, aussi bien dans les fermes que dans le milieu naturel. Il devient ainsi urgent de mieux faire connaitre la maladie à tous les acteurs de la filière et d’acquérir des données sur sa distribution. Une première étude présentant les résultats d’échantillons collectés sur carpes communes et koï en France entre 2013 et 2020 a mis en évidence une large distribution géographique du virus et une certaine diversité génétique parmi les 2 génogroupes viraux présents : les CEV détectés sur carpes communes se regroupent au sein d’un génogroupe particulier (gI) tandis que ceux isolés sur koï sont inclus dans un autre génogroupe (gII) (Baud et al., 2021). De multiples variants ont été détectés dans le gII ainsi que des traces d’évènements de recombinaison qui pourraient accélérer l’évolution du virus. Le projet CEViral qui a démarré en 2022 avec un financement FEAMP a de multiples objectifs :  recenser et caractériser les épisodes de mortalités en 2022 et 2023;  enrichir notre connaissance sur les conditions de survenue des épisodes de maladie; obtenir des données génétiques sur les variants viraux de 2021-2022-2023 afin d’étudier leurs distributions; caractériser par séquençage complet un virus du gI (gII déjà disponible). Cette étude portera sur des carpes en étangs ou fermes piscicoles, en parcours de pêche ou dans le milieu naturel. Elle s’adresse à tous les acteurs de la santé des poissons, vétérinaires et laboratoires, et à toutes les professions liées aux marchés de la carpe. La finalité du projet a pour vocation de soutenir la filière pisciculture d’étangs en : informant les acteurs des risques associés à la circulation du virus ; réfléchissant ensemble à une stratégie de lutte contre le CEV