Etude de l’activite modulatrice d’huiles essentielles sur la colonisation de campylobacter jejuni chez le poussin.

Campylobacter jejuni (C. jejuni) est une bactérie du microbiote caecal des volailles de chair, responsable d’une des premières causes d’infection d’origine alimentaire chez l’Homme. Le contrôle du développement de ce pathogène est essentiel, et la limitation de la population de C. jejuni en élevage constitue une mesure de prévention supplémentaire. Le but de cette étude est d’évaluer l’activité anti-bactérienne d’un additif à base d’huiles essentielles (additif phyto) contre C. jejuni ainsi que ses propriétés modulatrices du microbiote caecal chez le poulet de chair. Dès l’éclosion, 60 poussins Ross sont nourris ad libitum avec de l’aliment sans antibiotique selon le schéma expérimental : un groupe de 30 poussins supplémentés de J0 à J17 avec 500g/t de l’additif HE dans l’aliment (Groupe EXP) et un groupe de 30 poussins non supplémentés (Groupe Témoin). A J14, les poussins sont inoculés avec C. jejuni (10^4 UFC/oiseau). Trois jours post inoculation (J17), 15 oiseaux de chaque groupe sont euthanasiés et le contenu caecal est prélevé. Un dénombrement de C. jejuni est réalisé et les échantillons de chaque groupe sont classés en « fortement colonisé » (> 5log UFC/g) ou « faiblement colonisé » (<5log CFU/g). L’analyse statistique est réalisée avec le test exact de Fisher. Une analyse métagénomique des gènes codant l’ARNr 16S est menée en parallèle par séquençage haut débit avec la plateforme Illumina (MiSeq). L’abondance relative (en OTU) des taxons bactériens est analysée selon DESeq2. Cette étude montre que la supplémentation avec l’additif phyto tend à réduire post challenge (p=0.056) le nombre d’oiseaux fortement colonisés par C. jejuni (5 oiseaux sur 15 pour Groupe EXP sont faiblement colonisés par C. jejuni contre 11 sur 15 pour Groupe Témoin). De plus, l’analyse métagénomique montre que C. jejuni est un genre bactérien discriminant entre les groupes EXP et Témoin. En effet, l’abondance relative du genre Campylobacter est plus importante chez les oiseaux du groupe Témoin (p=0.009). Cette étude, combinant dénombrements bactériens et analyse métagénomique, montre que la supplémentation avec l’additif phyto tend à réduire la colonisation des oiseaux par C. jejuni en période d’exposition.