Caractérisation des souches d’Ornithobacterium rhinotracheale par sérotypage et spectroscopie infrarouge

Les infections à Ornithobacterium rhinotracheale (ORT) sont fréquentes en dindes de chair et causent des troubles respiratoires ou articulaires. L’objectif de l’étude est de caractériser des isolats d’ORT par sérotypage et par une méthode innovante, la spectroscopie infrarouge (IR), afin de déterminer des liens épidémiologiques éventuels et montrer une possible discrimination en fonction de l’organe d’isolement. L’IR permet d’étudier phénotypiquement des bactéries, contrairement aux outils qui s’intéressent à la génétique.Un échantillon de 41 isolats issus de 21 élevages de dindes élevées en Bretagne de janvier 2020 à avril 2021 a été analysé. Les isolats proviennent de différents organes de sujets présentant des signes cliniques. Sur un plan épidémiologique, l’IR regroupe dans un cluster plusieurs isolats issus de lots non contemporains d’un élevage. A contrario, 3 isolats d’un même lot de dindes se retrouvent séparés les uns des autres dans le dendrogramme. 88% des isolats appartiennent au sérotype 1 et sont sous-typés par IR. Parmi les 5 clusters distingués, l’un d’entre eux est dominant avec 23 isolats (56%) provenant de 15 élevages différents. Au sein de ce cluster, l’origine tissulaire des isolats est indifféremment respiratoire ou articulaire. L’IR apparaît intéressante en montrant soit la résidence d’une même bactérie au sein d’un élevage, soit une diversité d’isolats pouvant circuler dans un même lot. Des disparités sont observées par IR sur des isolats appartenant au sérotype 1 sans relation avec le tropisme d’isolement.