Caractérisation d’agents pathogènes par spectrométrie de masse MALDI-TOF : application aux bactéries du genre Tenacibaculum

Parmi les pathologies retrouvées en pisciculture marine, celles regroupées sous le terme génériques ténacibaculoses (ou flexibactérioses marines) frappent régulièrement des élevages de France mais également dans de nombreux pays. Les espèces responsables, appartenant au genre Tenacibaculum, sont encore mal décrites et l’identification de l’agent pathogène est encore imprécise. Notre étude a pour but de proposer un outil de diagnostic fiable, rapide et bon marché. Cet outil doit être capable d’identifier l’espèce et doit pouvoir permettre de caractériser plus finement les isolats (sous typage). Nous avons donc mis au point un schéma de caractérisation des espèces appartenant au genre Tenacibaculum reposant sur la spectrométrie de masse MALDI-TOF. Un schéma de sous typage pour l’espèce T. maritimum reposant sur un 9 biomarqueurs a été développé. Sur un total de 131 isolats de terrain, notre méthode permet d’identifier 20 MALDI-types, ainsi que 4 complexes clonaux. Cet outil pourrait permettre de faciliter la gestion des agents pathogènes dans les élevages et de proposer des études épidémiologiques. La méthode développée pourrait également être transposée à d’autres bactéries, par exemple d’agents pathogènes retrouvés en pisciculture.