Analyse rétrospective des enquêtes épidémiologiques en foyers de salmonelles dans les élevages de pondeuses en 2020

Le programme national de lutte contre les salmonelles en aviculture prévoit la réalisation d’une enquête épidémiologique sur les foyers d’infection dans les troupeaux de pondeuses d’œufs de consommation. Cette enquête vise à identifier les voies d’introduction et les réservoirs potentiels du pathogène sur l’exploitation afin d’orienter les opérations de décontamination et les mesures correctives pour éviter une récidive. Cependant, les informations collectées dans les enquêtes, si elles sont utilisées par les autorités vétérinaires locales et les vétérinaires sanitaires pour gérer les foyers, ne sont pas centralisées et analysées à l’échelle nationale alors qu’elles pourraient contribuer à améliorer les connaissances épidémiologiques sur l’infection et les mesures de prévention et de lutte collective. Afin d’exploiter ces données, l’Anses a mené, à la demande de la Direction Générale de l’Alimentation, une analyse rétrospective ponctuelle des questionnaires d’enquête épidémiologique sur les foyers d’infections salmonelliques en pondeuses survenus en 2020. Sur 156 foyers, 94 questionnaires ont pu être collectés et analysés. La synthèse des conclusions montre que les principales hypothèses d’introduction de la bactérie dans les troupeaux selon les enquêteurs (vétérinaires sanitaires et/ou autorités sanitaires) sont l’infestation du poulailler par les rongeurs, la rupture, ou dans certains cas, l’absence, de mesures de biosécurité et les contacts directs ou indirects d’oiseaux sauvages avec les poules. L’analyse statistique descriptive multidimensionnelle sur un sous-échantillon de 60 questionnaires complets a montré quatre profils distincts d’exploitations infectées, auxquels sont associés différentes hypothèses d’introduction de Salmonella ; ce résultat souligne la nécessité d’adapter les mesures de prévention aux différents profils d’exploitation. L’analyse des questionnaires a mis en lumière une qualité de remplissage variable, influencée, d’une part, par les moyens et l’expertise des enquêteurs et, d’autre part, par la nature de l’information demandée et le type de formulaire utilisé (standardisé, forme libre). L’intérêt d’une exploitation collective et régulière des enquêtes épidémiologiques a été démontré par cette étude mais sa réalisation nécessite une refonte de la méthodologie et des outils de collecte des données. Pour ce faire, un groupe de travail associant professionnels, vétérinaires, scientifiques et autorités vétérinaires a été mis en place en 2023 dans le cadre du groupe de suivi des salmonelles en aviculture de la plateforme Epidémiologie et Santé Animale.